Florecom kent een structuur van werkgroepen. In elke werkgroep zitten vertegenwoordigers van partijen in de handelsketen.

Werkgroep CMG (Change Management Group)
Doel: Beoordelen en vaststellen rfc's
Werkgroepleden: Afgevaardiging veiling, handel en softwareleveranciers

Werkgroep Standaarden
Doel: Overleg en begeleiden nieuwe ontwikkelingen
Werkgroepleden: Bernard van Raaij (Q-ray), Roel Voerman (FloraHolland), Ben Ensink (HBAG), Ingmar Hensbergen en Stef Spaan (GS1), Marjo van der Sman en Gerhard Heemskerk (Florecom)

Werkgroep Communicatie 
Doel: Afstemming externe communicatie
Werkgroepleden: Frans-Peter Dechering en Marjo van der Sman (Florecom), Marianne Wamsteker (VGB), Linda Schenkeveld (FloraHolland)