Florecom kent een structuur van werkgroepen. In elke werkgroep zitten vertegenwoordigers van partijen in de handelsketen.

Werkgroep CMG (Change Management Group)
Doel: Beoordelen en vaststellen rfc's
Werkgroepleden: Afgevaardiging veiling, handel en softwareleveranciers

Werkgroep Standaarden
Doel: Overleg en begeleiden nieuwe ontwikkelingen
Werkgroepleden: Bernard van Raaij (Q-ray), Roel Voerman (FloraHolland), Ben Ensink (HBAG), Michel Bloemsma (Plantion), Ingmar Hensbergen en Stef Spaan (GS1), Marjo van der Sman (releasemanager Florecom) en Gerhard Heemskerk (kwaliteitsmanager Florecom)

Werkgroep Communicatie 
Doel: Afstemming externe communicatie
Werkgroepleden: Leo van der Zon, Marjo van der Sman (Florecom), Marianne Wamsteker (VGB), Linda Schenkeveld (FloraHolland)